На викторианском приёме, устроенном в её честь, Алисе Кингсли предлагают руку и сердце Хэмиш, но она не спешит соглашаться и, спасаясь от неловкости, следует за Белым Кроликом, который появляется на лужайке в камзоле и с часами. Погоня приводит её к кроличьей норе, куда она падает сама и оказывается в странном подземном мире. В круглом зале с множеством дверей Алиса проходит через череду нелепых испытаний, уменьшается после напитка с надписью «ВЫПЕЙ МЕНЯ», затем вырастает после пирожного с надписью «СЪЕШЬ МЕНЯ» и, наконец, попадает в Подземную страну.
Там Алиса знакомится с Соней, Шляпником, Чеширским Котом, Абессалом, а также с Белой Королевой и Королевой Червей, чья жестокость держит всю страну в страхе. Постепенно Алиса понимает, что её появление связано с давним предсказанием и что именно ей предстоит вмешаться в надвигающийся конфликт. По мере того как напряжение между сёстрами-правительницами растёт, Алиса вынуждена выбрать сторону, собрать волю в кулак и решиться на поступок, который может изменить судьбу Подземной страны и её собственную жизнь.
